Вообще странно как-то, вроде вы братья так как выбрали определенный маршрут в своей жизни,но малость разными путями, а отличия между вами местами нехилая такая "яма".
Это смотря по каким критериям. У нас одни и те же ритуалы. У нас одни и те же секретные знаки. У нас одна и та же атрибутика.
Структура управления разная - у одних достаточно жесткая вертикаль, у других демократическая горизонталь иногда до абсурда. У одних это послушание, у других братство. У одних великие - это генералы, маршалы, "полубоги" (по разному бывает), у других это консьержи.
Две ветви: регулярная и либеральная. Иногда первые не считают вторых за братьев и никогда не допустят на свои работы, зато вторые, как правило, первых за таковых считают (опять же не везде и не всегда) и двери храма для них открыты. Одна система начала формирование с 27 декабря 1813 г. в лица Объединенной Великой Ложи Англии, вторая несколько раньше, с 24 июня 1738 в лице Великого Востока Франции. Что конкретно для Вас странно?